א. מוסדות האיגוד:
- יו"ר איגוד נבחר/ת בבחירות חשאיות כל שנתיים על ידי כלל הזכאים להצביע באיגוד, לתקופה של שנתיים, עם אפשרות להיבחר לשנתיים נוספות בלבד. היו"ר רשאי/ת לבקש בחירת סגן/נית או מזכיר/ה שיבחרו מתוך חברי הוועד. יו"ר יוכל/תוכל להיבחר שנית לאחר תקופה של 4 שנים מאז סיום תפקידו/ה כיו"ר האיגוד.
- הוועד הארצי נבחר על ידי כלל הזכאים להצביע באיגוד ויורכב מ-8 חברים רגילים + יו"ר האיגוד.
- מועצה ארצית, בה חברים כל מנהלי/ות מחלקות* העיניים בארץ, המוכרים/ות על ידי משרד הבריאות כמנהלי/ות מחלקה. רופאים/ות בעלי/ות תואר פרופסור חבר, חבר קליני או מן המניין, מנהלי/ות מחלקות לשעבר ופרופ' במעמד אמריטוס. נציג/ת המתמחים במעמד משקיף, מוזמן/ת לפי דרישת/בקשת הוועד. כל רופא/ה במעמד כלשהו שהמועצה ממליצה לקבלו/ה למועצה, בין אד הוק או בקביעות, ואשר קיבל אישור הוועד.
(* מחלקה = מחלקה המוכרת להתמחות או מסונפת לאוניברסיטה).
- ועדת בקורת - תורכב מ-3 חברים/ות אשר יומלצו על ידי המועצה ויקבלו את אישור הוועד.
- גזבר/ית שייבחר מתוך חברי/ות הוועד.
ב. אחת לשנה, ידווח/תדווח יו"ר האיגוד או נציגו/ה על פעולות הוועד והאיגוד השוטפות ויגיש/תגיש דו"ח פרופסיונלי וכספי.
ג. בהתאם לתקופות המצוינות בתקנון הה"י ייבחרו חברים/ות למוסדות וועדות האיגוד השונות.